质粒DNA的提取及电泳检测 下载本文

内容发布更新时间 : 2024/5/20 10:55:00星期一 下面是文章的全部内容请认真阅读。

实验 质粒DNA的提取及电泳检测

一 实验目的

通过本实验学习掌握碱裂解法提取细菌质粒DNA。 二 实验原理

1. 细菌中有两种DNA,即染色体DNA和质粒DNA。

2. 质粒DNA的提取方法有三种:碱裂解法,煮沸法,去污剂(如Triton和SDS)裂解法。

3. 碱裂解法比较剧烈,可破坏碱基配对,使宿主细胞DNA变性,共价闭合环状DNA由于空间缠绕,两条链不会彻底分开。当外界条件到达复性条件时,质粒DNA的双链又迅速恢复原状,而较大的线性染色体DNA难以复性。 三 实验材料:转化后的细菌(含有质粒的大肠杆菌) 四、实验用具和药品 1. 实验用具:

摇床,离心机,移液器及枪头,玻璃试管(15mL)及塞子,离心管(1.5mL) 2. 实验试剂: (1)溶液I

50 mmol/L 葡萄糖

25 mmol/L 三羟甲基氨基甲烷(Tris)Tris·HCl(pH8.0) 10 mmol/L 乙二胺四乙酸(EDTA)(pH8.0) (2)溶液II

0.4mol/L NaOH,2%SDS,用前等体积混合 (3)溶液III 5 mol/L 乙酸钾 60ml 冰乙酸 11.5ml 水 28.5ml (4)TE 缓冲液

10 mmol/L Tris·HCl(pH8.0) 1 mmol/L EDTA(pH8.0)

(5)70%乙醇(放-20℃冰箱中,用后即放回) (6)加样缓冲液(6X):40%蔗糖、0.25%溴酚兰

(7)电泳缓冲液:0.045mol/L Tris-硼酸 0.001mol/L EDTA (0.5X TBE buffer)

电泳缓冲液贮存液:5X:54g Tris碱、27.5g硼酸、20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 五 实验步骤 (一)细菌繁殖

挑取白色的单菌落若干,转移到3mL液体LB培养基(附加100mg/ml Amp ),37℃过夜振荡(200r/min)培养。 (二)菌体收集

将过夜培养的菌体转入1.5mL离心管,离心30sec 5000r/min;弃上清提取质粒 (三)质粒提取

方法一:碱裂解法提取质粒DNA

1..将上述沉淀重悬于250μL冰预冷的溶液Ⅰ中,剧烈震荡; 2.加入250μL溶液Ⅱ,盖紧管口,快速颠倒离心管5~10次;

3.加入350μL冰预冷的溶液Ⅲ,盖紧管口,温和地颠倒离心管5~10次;9000r/min离心5min上清转移到另一新1.5mL离心管中;

4.加等体积氯仿,振荡混合,静臵, 9000r/min离心5min,上清转移到另一新1.5mL离心管中;

5.加入1/10体积3mol/L的醋酸钠和2倍体积的乙醇,充分混匀,静臵5min;9000r/min离心5min;

6.弃上清,用70%ethanol洗涤; 7.加30μLTE溶解,-20 ℃保存。 方法二:试剂盒提取方法

1.离心收集的菌体中加入含RNAase的溶液Ⅰ250μL,重悬菌体,不应留有小的菌块;

2. 加溶液Ⅱ250μL,轻轻颠倒离心管4-6 次,使菌体充分裂解,至溶液澄清; 3. 加入350μL冰预冷的溶液Ⅲ,温和并充分地上下翻转混合6-8 次; 4. 12000r/min离心10min;

5. 将上清转移到DNA结合管(臵于2 ml 离心管中),12000r/min离心1min,弃滤液;

6. 将制备管臵回离心管,加入去蛋白试剂500μL,12000r/min离心1min,弃滤液;

7. 将制备管臵回离心管,加洗涤液700μL,12000r/min离心1min,弃滤液;以

同样的方法再用700μL洗涤液洗涤一次,弃滤液。

8. 将制备管臵回2 ml 离心管中,12,000×g 离心1 min,去除残余的洗涤液; 10 将DNA结合柱放入另一个新的1.5mL离心管中,在制备管膜中央加60-80μL洗脱液或去离子水,室温静臵1 min。12,000×g 离心1 min。 (四)检测提取DNA质量的电泳检测。

? 取4ul质粒DNA+2ul加样缓冲液+6ul ddH2O; ? 配制1%的琼脂糖凝胶 ? 电泳30min,EB染色,拍照。

注意事项:氯仿对眼睛、皮肤、粘膜及呼吸道都有刺激作用,它是致癌剂并可损伤肝脏和肾脏,操作时需戴手套、口罩。 六 实验作业

1. 思考本实验的关键步骤是什么?

2. 琼脂糖电泳鉴定质粒DNA时,能看到几条带,快慢顺序是什么? 3. 附上电泳图片。